Senyawa enzim merupakan biomolekul kompleks yang berperan vital dalam hampir seluruh proses biologis sebagai katalisator. Secara kimiawi, enzim sebagian besar tersusun atas protein, meskipun ada pula yang berupa asam ribonukleat (RNA) yang dikenal sebagai ribozim. Struktur dasar protein enzim dibentuk oleh rantai panjang asam amino yang terhubung melalui ikatan peptida, membentuk polimer dengan berat molekul yang sangat bervariasi, mulai dari beberapa ribu hingga jutaan Dalton. Setiap asam amino memiliki gugus karboksil (-COOH) dan gugus amino (-NH2) yang terikat pada atom karbon alfa (Cα) yang sama, serta rantai samping (gugus R) yang unik. Gugus R inilah yang menentukan sifat kimiawi spesifik dari masing-masing asam amino dan, pada akhirnya, mempengaruhi struktur tiga dimensi serta fungsi katalitik enzim secara keseluruhan. Pembentukan ikatan peptida melibatkan reaksi kondensasi antara gugus karboksil dari satu asam amino dengan gugus amino dari asam amino lainnya, melepaskan molekul air (H2O). Ikatan peptida (C-N) memiliki karakter ikatan parsial ganda karena resonansi, yang membatasi rotasi bebas dan berkontribusi pada kekakuan struktur primer protein.Struktur molekul enzim sangat hierarkis, dimulai dari struktur primer (urutan asam amino), sekunder (lipatan lokal seperti α-heliks dan β-sheet yang distabilkan oleh ikatan hidrogen), tersier (pelipatan tiga dimensi keseluruhan rantai polipeptida), hingga kuarterner (interaksi antar subunit polipeptida yang berbeda). Atom-atom karbon dalam tulang punggung protein umumnya memiliki hibridisasi sp3, kecuali atom karbon pada gugus karbonil (C=O) yang berhibridisasi sp2. Atom nitrogen pada ikatan peptida juga memiliki karakter sp2 karena resonansi. Ikatan kovalen merupakan jenis ikatan dominan yang membentuk struktur primer enzim, seperti ikatan peptida dan ikatan disulfida (-S-S-) yang...
